ケースのサイドパネルを開けっ放しにすると何か問題がありますか？

まず挙げられる問題はホコリが溜まりやすくなることです。パソコンのパーツは精密機器であるためホコリは大敵です。ケースのサイドパネルを開けっ放しにするとホコリが侵入しやすくなります。ですので、通常時はケースのサイドパネルをきちんと閉めたほうがよいと思います。

あと、サイドパネルを開いたままでパソコンを稼動すると、ケース内のエアフローが悪くなり、かえって冷却効果が下がる、という話を聞いたことがあります（その一方で、エアフローの設計が悪いものは開放したほうが冷える、という話も・・・）。

とはいえ、開けっ放しにして使用したからといって、いきなりパソコンが故障するとか動作が不安定になるとかいったことは通常は起こりません。ですので、組立やパーツ交換での動作確認のときなど、一時的に開けっ放しの状態にするのは問題ありません。